台湾琉球区渔会的渔船3月21日早上通报渔业电台，称在苏门答腊海域遭印度尼西亚籍巡逻船开了12枪。据台湾“中央社”22日报道，印尼官方首次证实称，印尼巡逻船曾朝台湾渔船射击，同时强调，台湾渔船“非法捕鱼”，遭印尼巡逻船拦截后未停下并企图冲撞巡逻船，这才遭到射击。
报道称，印尼渔业部长苏西(Susi Pudjiastuti)表示，印尼巡逻船“鲨鱼”号曾试着向台湾渔船沟通，但没有得到回应。开枪警告后，对方仍没有停船，反而要冲撞“鲨鱼”。随后“鲨鱼”号朝驾驶舱开枪。为了避免死伤，“鲨鱼”号让渔船离开印尼海域。
苏西还提供了一段印尼巡逻船拍摄的影片，时长1分32秒，其中可以清楚看到印尼巡逻船紧跟在台湾渔船“圣德财”左后方，并多次把灯光打向“圣德财”，示意停船未获回应，“圣德财”继续向前航行。但影片中并没有渔船故意冲撞巡逻船以及巡逻船开枪的画面。
苏西表示，当时台湾渔船没有悬挂“国旗”，正在捕鱼。从影片中可以看到一条单丝绳挂在船的右后方，表示该艘船正在进行作业。她指出，两艘台湾渔船是在印尼海域受到追捕。印尼的原则就是，一旦在印尼海域出现无国籍渔船，必需扣船抓人，清空人员后予以击沉。
对于印尼官员的说法，台湾“渔业署署长”蔡日耀回应称，通过对被枪击的渔船进行卫星定位判断，渔船当时的航行速度不可能在捕鱼，需要进一步调查。蔡日耀表示，目前双方说法“对不起来”，若台湾渔船真的在印尼经济水域捕鱼，则是违法作业;但若台湾渔船没有作业，印尼船只开枪就属于违反国际规定。
据台湾“渔业署”此前公布的消息，“圣德财”号船只遭到枪击后船体留有10余个弹孔，所幸两艘船上20多人均平安，两艘船只预计明后天抵达新加坡。
