冯亚军，男，汉族，1966年9月生，江苏海门人。大学本科学历，中央党校硕士研究生学历，博士学位。1988年6月加入中国共产党，1993年8月参加工作。
曾先后任南京市栖霞区栖霞镇党委副书记、镇长;南京市栖霞区副区长、党组成员;南京市栖霞区委常委、副区长、党组成员;南京市栖霞区委常委、副区长兼南京仙林大学城党工委副书记、管委会副主任;秦淮区委副书记等职务。
2004年12月—2005年1月，任中共江苏省南京市秦淮区委副书记、代区长;
2005年1月—2011年6月，任中共江苏省南京市秦淮区委副书记、区长;
2011年6月—2012年10月，任中共江苏省南京市建邺区委书记;
2012年10月—2013年1月，任中共江苏省南京市建邺区委书记、南京市生态科技岛管委会主任;
2013年1月—2014年3月，任江苏省南京市河西新城区开发建设指挥部常务副指挥长、建邺区委书记、区人大常委会主任;
2014年3月—2014年9月13日，任江苏省南京市委常委、南京市河西新城区开发建设指挥部常务副指挥长、建邺区委书记、区人大常委会主任(正厅级)。
