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本科二本（又称本科二批）是指放在中国高考录取招生的时候在本科层次第二批次招生的学校，录取线一般要达到本二线。本科层次第二批次招生的学校，录取线一般要达到本二线，学年制通常为4—6年，学生毕业后颁发本科学历毕业证和学士学位证书。本科第二批学校主要是省属本科院校和普通公办本科院校，综合实力通常低于在高考进行本科一批录取的院校，有些全国高校中综合实力靠前的学校也在高考本科第二批中招生。
本科第二批录取院校只是个模糊的概念，指的是录取批次放在第二批的大学，每个省的情况都不大一样。比如安徽理工大学，在外省是放在普通二本批次录取的，但是在安徽本省和几个指定省份就是一本（包括重点一本、普通一本）录取，又如西南财经大学天府学院是一所财经类独立学院，在江苏，江苏，福建，上海等省市招收本科第二批次考生，其它省份招收三批考生，所以西南财经大学天府学院也是二本。此类二本学院还有“长春建筑学院”、“长春科技学院”等。
1 南京大学 教育部 南京市本科
2 东南大学 教育部 南京市 本科
3 中国矿业大学 教育部 徐州市 本科
4 河海大学 教育部 南京市 本科
5 江南大学 教育部 无锡市 本科
6 南京农业大学 教育部 南京市 本科
7 中国药科大学 教育部 南京市 本科
8 南京理工大学 工业和信息化部 南京市 本科
9 南京航空航天大学 工业和信息化部 南京市 本科
10 苏州大学 江苏省 苏州市 本科
11 扬州大学 江苏省 扬州市 本科
12 江苏大学 江苏省 镇江市 本科
13 南京邮电大学 江苏省 南京市 本科
14 江苏科技大学 江苏省 镇江市 本科
15 南京工业大学 江苏省 南京市 本科
16 南京林业大学 江苏省 南京市 本科
17 南京医科大学 江苏省 南京市 本科
18 南京中医药大学 江苏省 南京市 本科 1
9 南京师范大学 江苏省 南京市 本科
20 徐州师范大学 江苏省 徐州市 本科
21 南京财经大学 江苏省 南京市 本科
22 南通大学 江苏省 南通市 本科
23 西交利物浦大学 江苏省教育厅 苏州市 本科
24 南京信息工程大学 江苏省 南京市 本科
25 淮阴工学院江苏省 淮安市 本科
26 徐州工程学院 江苏省 徐州市 本科
27 淮海工学院 江苏省 连云港市 本科
28 常州工学院 江苏省 常州市 本科
29 盐城工学院 江苏省 盐城市 本科
30 江苏工业学院 江苏省 常州市 本科
31 金陵科技学院 江苏省 南京市 本科