爱琴海上的伊米亚岛战略地位十分重要。如果希腊对该岛拥有主权，那么希腊对几乎整个爱琴海就拥有了控制权，这样一来，土耳其在地中海的影响就会大打折扣。因此，土、希对这个小岛都不肯放手，而双方的海军就是它们争岛的筹码。
总体兵力数量：土耳其占上风
土耳其海军总兵力5.1万人(含海军陆战队)。而作为欧洲海军最早发祥地的千岛之国———希腊，其海军仅有兵力1.95万人，还不到土海军的1/2。
在武器装备方面，土耳其拥有常规潜艇15艘、驱逐舰5艘、护卫舰22艘、导弹快艇18艘、巡逻艇32艘、布雷舰艇3艘、反水雷舰艇21艘、登陆舰8艘、登陆艇59 艘与辅助舰船14艘，还有用于反潜作战的直升机16架。而希腊海军则装备有潜艇 8艘、驱逐舰4艘、护卫舰17艘、导弹快艇19艘、巡逻艇10艘、鱼雷艇8艘、布雷舰 2艘、扫雷舰14艘、两栖登陆舰艇10艘与支援舰船14艘，另装备有P-3型海上巡逻机6架、直升机17架(其中反潜直升机15架、电子战直升机2架)。相比之下，土耳其的常规潜艇是希腊的2倍，扫雷舰是希腊的1.5倍，护卫舰、反潜直升机与导弹快艇则基本相当。因此，单从数量上看，土耳其海军力量要强于希腊。
驱逐舰性能：不相上下
由于希腊与土耳其均为北约成员国，两国驱逐舰性能差异不大。希腊的导弹驱逐舰排水量4500吨，舰长133.2米，航速35节，续航力8000海里，舰员编制(官/兵)24/330人。而土耳其的主要作战驱逐舰长133.5米，最大排水量4250吨，航速27节，续航力4000海里，舰员编制250~282人。虽土耳其驱逐舰续航力不足，但土耳其海军并不是一支远洋海军，也不影响其在爱琴海的行动。
在防御系统方面，希腊主战驱逐舰装备有127毫米高平两用炮2门、“鱼叉” 4联反舰导弹发射器2具、“鞑靼人”防空导弹发射器1具、“阿斯洛克”反潜导弹 1具、反潜鱼雷发射管6具;相应的土耳其主力驱逐舰装备有76毫米舰炮1座、Mk1 5型密集阵近防炮2座、8联装反潜导弹发射装置1座以及2座双联装Mk32型324毫米鱼雷发射管。虽然希腊的驱逐舰装备有“鱼叉”反舰导弹和防空导弹，但土耳其的驱逐舰装备有先进的“密集阵”防空系统与“阿斯洛克”反潜导弹，双方各有千秋。
在电子设备方面，希腊驱逐舰配有TDS战术指挥系统、塔康战术导航系统、W SC-3卫星通讯、SPS-39/37对空雷达、SPS-10对海雷达、SPG-53A炮瞄雷达、 MK74/68/114火控雷达与SPG-51C制导雷达以及SQS-23声呐系统。土耳其的驱逐舰则配有SPS-40B型两坐标对空搜索雷达、SPS-10型对海搜索雷达、SPG-53型火控雷达、Mk114型火控雷达。相比而言，两国在电子设备方面大部分都属于同种类型的电子器件，功能相差不大。
潜艇性能：土耳其稍强
虽然两国都是进口德国的209级潜艇，但其性能却不相同。希腊采购的209/1 100潜艇水上排水量1100吨，水下为1210吨，全长54.4米，水上速度11节，水下2 1.5节，艇员31人。土耳其采购的则是改进后的209潜艇，其水上排水量1454吨，水中1586吨，全长62米，水上航速15节，水下21.5节，艇员30人。其排水量与水上航速均大于希腊的潜艇。在武器装备方面，土耳其的209型潜艇装备有8个鱼雷发射管，使用SST-4鱼雷。SST-4鱼雷在一击不中的情况下，可重新进行攻击。而希腊的209型潜艇使用的是DM-2A1反舰鱼雷与DM-1反潜鱼雷，其性能远不如SST-4 鱼雷。而且，土耳其潜艇还可使用美制“鱼叉”型潜射导弹。在隐蔽性方面，土耳其209型下潜安全深度为280米，极限深度约为700米，而希腊的209型潜艇下潜安全深度为250米，极限深度约625米，其隐蔽性不如土耳其的209型潜艇。