多名民进党“立委”抛出所谓“两国论版”的“两岸协议监督条例”草案后，民进党中央下令要求他们撤回。
据台湾《联合报》13日报道，目前民进党“立委”李应元、李俊俋以及尤美女等人都就“两岸监督条例”草案提出自己的版本，其中不乏“两国论”的内容。像尤美女版本的“两岸协议缔结条例草案”第二条第一项称，本条例所指称之两岸协定，“指台湾中华民国政府与大陆中华人民共和国政府之间，直接或委托法人、团体或其他机构协商，所签署之书面文件、共同公布之记录、或发表之联合声明，及其增补修正”。虽然法案名称避开了“两国论”的敏感争议，条文内容却确立了“两国两府”定位。该草案3月初出炉后，获得20多个“立委”的联署。《联合报》透露，蔡英文为了避免党内“立委”与党中央步调不同，下令个别“立委”撤回已提出的相关法案版本，希望届时进入委员会审查的只剩民进党版、“行政院版”以及“时代力量”的版本，“颇有执政前统整步伐的味道”。报道还说，民进党版的名称几乎确定会使用“两岸”字眼，争议内容不会纳入，但为了与目前的“行政院版”有所区别，对于监督的力道还是会“比较严格”。
对此，“立委”态度不一。尤美女称，未来在委员会审查时必须包括民间版的声音，如果党版也包括民间版主张，她要不要撤案就不是重点。“立委”苏巧慧称，未来若有其他人的版本更好，她不会非坚持不可;在未看到党版之前，她认为自己的版本是好的，希望有被讨论的空间。
新“立法院”开议至今，民进党“立委”从废除“国父”遗像等各种“转型正义”提案，到争相提出“两国论版”的监督条例，屡屡引发争议，让党中央头痛不已。《联合报》13日评论称，民进党重回执政，两岸关系成为左右台湾未来的关键因素之一，“但向来习惯大鸣大放的立委们如何转型，恐怕是新政府未来任期内持续要面对的挑战”。文章说，对“两岸监督条例”祭出撤案令，凸显蔡英文对党和“立法院”在两岸议题上“统整步伐”的期待，“所谓当家才知盐米贵，出门才晓路难行，应是现在准执政党心情的最好写照”。
