1948年8月，东线战勤司令部组编为东北野战军后勤部第二、三两个分部，常树人任第二分部部长，参加了辽沈战役。
1948年12月，东北人民解放军炮兵司令部和炮兵纵队合编为东北野战军特种兵司令部，常树人任后勤部部长。参加了平津战役。
1949年4月，东北野战军特种兵司令部改编为第四野战军特种兵司令部，常树人仍任后勤部部长。后任野战军炮兵后勤部部长。
(三)
新中国成立后，常树人任中央军委炮兵后勤部部长。
1951年2月，军委炮兵后勤部撤销，常树人调任海军后勤部第二副部长。
1956年9月，常树人进入海军学院高级速成班学习。
1958年8月结业后，常树人任海军后勤部副部长兼参谋长。
1962年12月，常树人任海军后勤部副部长。
“文革”期间，常树人受到林彪、“四人帮”的诬陷、打击和迫害，被批斗了五年。虽身处逆境，但始终坚信党，对革命充满信心，保持共产党员的本色。在以后待分配工作的五年中，仍以党的利益为重，坚持做力所能及的工作。
1978年，常树人恢复原职。他不计名，不为利，坚决拥护和贯彻党的十一届三中全会制定的路线、方针、政策，自觉地在政治上与党中央保持一致。
1983年3月，经中央军委批准，常树人按副兵团级待遇离职休养。
常树人1964年晋升为少将军衔，荣获二级独立自由勋章、二级解放勋章。
1984年8月29日，常树人因患肺癌在北京逝世，享年69岁。常树人生前留下遗嘱：“不开追悼会，不举行遗体告别仪式;不留骨灰;遗体做病理解剖，贡献给医学事业。”表现了他崇高的思想境界，受到领导赞扬和广大群众的称颂。
