毛泽东很清楚，林彪是要抢班夺权，陈伯达就是为林彪打前阵的。
但在当时，毛泽东还不能立刻把林彪揭出来，他要分化林、陈，先批陈，这样可以保证政局稳定。于是，他动笔写了《我的一点意见》，矛头直指陈伯达编的《恩格斯、列宁、毛主席称天才的几段语录》。毛泽东的《我的一点意见》发给了全体与会者，一下子就把会议风向转了过来。参加会议的人开始批判陈伯达，林彪及其手下也不讲话了。
陈伯达感到冷水浇头，从上凉到下。但是，他把毛泽东写的《我的一点意见》拿起来反复看了多遍后，又冷静下来了。他看到，毛泽东的这封信里，还只是说陈伯达不懂马列主义，搞谣言和诡辩，搞突然袭击，煽风点火，唯恐天下不乱。他觉得，毛泽东还没有把他打倒的意思。但是，毛泽东到底怎么想，他也不清楚。加上江青一伙攻他攻得厉害，与会者也开始把他当作批判的靶子，林彪等人也不说话。他知道，此时能够救自己的，只有毛泽东，于是，便向毛泽东求见。见面后，陈伯达听毛泽东讲的，都是他工作作风方面的小事，并没有提到理论上和政治上的重大分歧，才松了一口气。他赶紧向毛泽东作检查，说自己犯了重大错误，搞天才论，搞唯心主义，主张设国家主席，不听主席的话。但没提到到他和林彪勾结，一起向中央施加压力的事。毛泽东听了陈伯达的检查，并不满意。他让陈伯达去找江青、康生、张春桥、姚文元一起谈一谈，和他们“团结起来”。第二天，陈伯达去了江青的住处。江青一见面就对陈伯达冷言冷语，然后把陈伯达领到了康生的住处，张春桥、姚文元早就等在了那里。陈伯达一坐下，他们你一言，我一语，轮番批养陈伯达。他们给陈伯达上纲，认为陈伯达是“反党分子”。陈伯达心里虽然不愿意，但为了过关，只好硬着头皮听着，并且表示要写检查。又过了一天，中央政治局在庐山会议上宣布，要陈伯达写检查。陈伯达认为，毛泽东让他写个检查，就是让他过关，这件事就结束了，因此，他的心情放松了。康生代笔替他写了检查稿，陈伯达看后，略作了修改，也就同意把自己的检查下发了。此后，他觉得自己的事情过去了，也就不再在意了。
江青成了“批陈先锋”
但是，陈伯达没有料到，林彪一伙会把一切责任都推到自己身上，更没有料到，江青会一心要把自己置于死地。
毛泽东写的《我的一点意见》下发后，九届二中全会上立即掀起了批陈之风。林彪及其手下亲信也受到大家的怀疑和批判。林彪一看事情不妙，赶紧让叶群向他手下亲信们打招呼，让他们把一切责任都推到陈伯达的身上，发言时，大家就都说是自己思想理论水平低，上了陈伯达的当，把问题推得一干二净。
江青集团抓住此事，穷追猛打。他们不敢直接攻击林彪，就揪住陈伯达不放，非要将陈伯达置于死地。
江青先后搞出了两个材料，一个是《关于传达陈伯达反党问题的指示》，一个是《反党分子陈伯达罪行材料》。前一个材料，把陈伯达定性为反党分子，后一个材料，在原来给陈定的“反党分子”基础上，又把陈伯达定为“叛徒”、“国民党特务”。毛泽东看后，相信了这个材料。
此后，在全国展开的“批陈整风运动”中，江青成了批陈先锋。她到处作报告，批判陈伯达的反党罪行。在江青等人的推动下，全国很快就掀起了批陈的高潮。
江青想置陈伯达于死地，毛泽东救了陈伯达
1971年九一三事件后，陈伯达又成了被关注的对象，“四人帮”想趁机将他置于死地。
9月13日晚，突然有几个彪形大汉闯进陈伯达住的房间，不容分说，架起陈伯达就走。他们把陈伯达推上了门口的一辆汽车，开了就走。路上一片漆黑，陈伯达在车里也看不清是往哪里开，到了目的地才看清是秦城监狱。就在押送他的人把他架到秦城监狱关押他的牢房里时，他突然挣扎着高叫道：“你们要转告毛主席，转告党中央，我陈伯达在阜平时是做过一件好事的！我不是国民党特务！”原来，陈伯达看到，这是一间条件特别差的牢房。一个堂堂中央政治局常委被关在这样的牢房中，那是必死无疑了。为了求生，他才高叫起来。这一声高叫确实救了他的命，而且没过几天他在狱中的待遇也大为改善。这又是为什么呢？
据聂荣臻回忆，1948年，毛泽东率中央机关住到了河北省阜平县的城南庄，刚住下，就有暗藏的国民党特务向国民党军队报告了毛泽东的详细住址。一天，一直平静的城南庄的上空突然响起了飞机声，不一会，国民党的几架轰炸机出现在城南庄上空。毛泽东正在屋子里批复电文，没当一回事。陈伯达听见了飞机声，立即感到大事不好，他急忙往毛泽东住的屋子里跑，高声喊道：敌机来了，敌机来了，主席快走。毛泽东这才意识到问题严重。陈伯达叫几个战士架着毛泽东赶快撤。毛泽东刚走出院门，敌机扔下的炸弹就落在毛泽东住的院子里。
毛泽东能躲过此劫，陈伯达是有功的。陈伯达在秦城监狱一声高喊，就是喊给毛泽东听的。别人听不懂这句话的意思，但毛泽东懂。如果陈伯达真是国民党特务分子，那时是不会冒着生命危险去救他的。因此，江青和康生搞的陈伯达的材料是不真实的。对此，毛泽东心中清楚。但是，批陈整风是大局，陈伯达也确实跟林彪搞在了一起。所以此后，毛泽东对陈伯达在政治上批得很严厉，但在生活上一直给予关照。不久，全国把批判的重点转向了林彪，“批陈整风”也改为“批林整风”。对陈伯达的批判，也就逐渐淡化了。
由此，陈伯达对毛泽东一直心存感激。否则，就
